磁珠法病原微生物DNA/RNA提取试剂盒说明书
货号: M02930
规格:96T
英文名称:Magbead Pathogenic Microbiome DNA/RNA Kit
保存:RT,1年
产品组成:
Component | 96T | |
Buffer LBS-A | 50 mL | |
Buffer WB1 | 100 mL | |
Buffer WB2 | 100 mL | |
RNase-Free Water | 10 mL | |
Proteinase K | 2×1.25 mL | |
Magbeads PN | 2×1 mL | Magbeads PN使用前,涡旋以保证充分重悬 |
Lysis Tubes | 96 |
产品说明(仅供参考):
本试剂盒适用于从血浆、血清、肺泡灌洗液等生物液体样本中纯化和富集病毒、细菌和真菌等病原微生物DNA及RNA。用本试剂盒纯化的微生物DNA及RNA适用于多种下游应用,包括PCR、RT-PCR、荧光定量PCR、NGS等各种下游实验。
自备仪器、试剂
1. 2/15 mL磁力架或32通道核酸提取仪(例如康为CWE3200/CWE2100)
2. 异丙醇
3. PBS缓冲液
实验前准备及注意事项
1. 使用前请检查Buffer LBS-A是否出现沉淀,如有沉淀出现,请置于56℃水浴重新溶解。
2. 本试剂盒旨在从完整的微生物细胞中分离DNA及RNA,为了保证微生物DNA及 RNA的最佳回收效率,样品应保证新鲜。如果需要储存或运输,最好在2~8°C条件下进行,不可冻融,冻融会损坏微生物细胞的完整性。
3. 为避免由于污染造成的错误结果,请保持工作区域清洁和穿防护服,并合理设置对
4. 照品进行质控。采用适当措施处理样品材料,降低交叉污染的风险。提取过程中,使用DNA/RNA-free的移液器吸头和消耗品,试剂使用完后立即盖好瓶盖,防止污染。
操作步骤
一 手动操作
1. 样本前处理:
1a:尿液、胸腹水、脑脊液等非粘稠体液样本直接取400 μL样本,进行第2步操作。
1b:拭子类样本(如鼻、咽及肛拭子等)涡旋振荡混匀后,直接取400 μL进行第2步实验。
1c:痰液、肺泡灌洗液样本取适量液化痰液样本至1.5 mL 离心管中(液化方法推荐使用1.5倍体积的Buffer GB1,本试剂盒不提供),12,000 rpm离心5 min,弃上清,使用400 μLPBS重悬沉淀后提取。对于含有少量粘稠痰液的肺泡灌洗液,将尽量多的肺泡灌洗液样本先进行离心,小心去除上清,留取下层粘稠部分(含痰液、细胞、菌体)参照痰液样本进行液化处理。
1d:血液类样本
血清、血浆及少量全血样本(少于200μL)可直接取400μL(少量全血使用PBS补足)进行第2步实验,大体积全血样本推荐使用红细胞裂解液(CB3116)处理后再进行提取。
可选去宿主步骤(搭配宿主DNA去除试剂盒例如康为CW3169S)
2. 向Lysis Tubes中加入400μL样本和400 μL Buffer LBS-A,可用以下振荡方式处理:
a)将Lysis Tubes置于室温涡旋振荡10 min;
b)将Lysis Tubes置于恒温混匀仪上以最大振速(2500~2900 rpm)处理10 min;
c)将Lysis Tube 置于样本均质仪中,可根据不同品牌的仪器选择合适的程序进行裂解:如使用MP公司FastPrep-24-5G(6 M/S的速度振荡30 sec,间隔30 sec,共6个循环)。
3. 室温12000 rpm离心1min,转移600μL上清至新的离心管中,加20 μLProteinase K(若经过去宿主处理,则此步不需再加Proteinase K),涡旋震荡混匀5 s后,置于65℃ 600 rpm孵育10 min。
4. 瞬离离心管,确保管壁无液体残留后,在离心管中加入20 μL Magbeads PN和300 μL异丙醇,涡旋5 s后,室温,1500 rpm孵育5 min。
注:Magbeads PN使用前,涡旋以保证充分重悬。
5. 瞬离离心管,确保管壁无液体残留后,将离心管置于磁力架上静置2 min或至磁珠完全吸附,用移液器小心吸弃所有上清。
6. 在离心管中,加入500 μL Buffer WB1,室温,1500 rpm孵育3 min,将离心管置于磁力架上静置2 min或至磁珠完全吸附,用移液器小心吸弃所有上清。
7. 重复步骤6一次。
8. 在离心管中,加入500 μL Buffer WB2,室温,1500 rpm孵育3 min,将离心管置于磁力架上静置2 min或至磁珠完全吸附,用移液器小心吸弃所有上清。
9. 重复步骤8一次。
10.离心管放置于磁力架上,敞盖晾干5 min。
11.在离心管中加入70 μL RNase-Free Water ,用移液器吹打混匀,置于56℃ 600 rpm孵育5 min。瞬离离心管后,将离心管置于磁力架上静置2 min或至磁珠完全吸附,用移液器转移所有上清至新离心管中。
获得的核酸溶液置于-20℃长期保存。
二 与核酸提取仪例如康为CWE3200/CWE2100匹配
1. 样本前处理同手动操作步骤1。
2. 在Lysis Tubes中加入400 μL样本、400 μLBuffer LBS-A,室温振荡处理10 min,振荡方法同手动操作步骤2,室温12000 rpm离心1min。
- 按照下表在96深孔板中分装试剂
位置 | 试剂 | 体积 |
第 1 、7 列 | 异丙醇 | 300 μL |
第 2 、8 列 | Buffer WB1 | 500 μL |
第 3 、9 列 | Buffer WB1 | 500 μL |
第 4 、10 列 | Buffer WB2 | 500 μL |
第 5 、11列 | Buffer WB2 | 500 μL |
第 3 、9 列 | Magbeads PN | 20 μL |
第 6 、12 列 | RNase-Free Water | 70 μL |
- 在分装好试剂的96深孔板第1、7列中加入600 μL步骤1中上清样本、20 μL Proteinase K (若经过去宿主处理,则此步不需再加Proteinase K)。
- 按照下表编辑并运行提取程序:
步序 | 磁棒 位置 | 步骤 名称 | 温度 | 释放 磁珠 | 搅拌 速度 | 时间 | 循环 次数 | 磁吸 次数 | 磁吸 时间 |
1 | 1 | 裂解 | 65℃ | 是 | 中速 | 10 min | 1 | 0 | 0 |
2 | 3 | 收集磁珠 | 0 | 否 | 快速 | 5 s | 1 | 2 | 10 s |
3 | 1 | 结合 | 0 | 是 | 中速 | 5 min | 1 | 2 | 10 s |
4 | 2 | 漂洗 | 0 | 是 | 快速 | 2 min | 1 | 2 | 10 s |
5 | 3 | 漂洗 | 0 | 是 | 快速 | 2 min | 1 | 2 | 10 s |
6 | 4 | 漂洗 | 0 | 是 | 快速 | 2 min | 1 | 2 | 10 s |
7 | 5 | 漂洗 | 0 | 是 | 快速 | 2 min | 1 | 2 | 10 s |
8 | 5 | 干燥 | 0 | 5 min | |||||
9 | 6 | 洗脱 | 56℃ | 是 | 中速 | 5 min | 1 | 3 | 10 s |
10 | 3 | 释放磁珠 | 0 | 是 | 快速 | 5 s |
- 程序运行结束后,取出96深孔板,将第6 、12列中的洗脱液转移至新离心管中, -20℃长期保存。